软下疳的病原体是杜克雷嗜血杆菌，该菌为短而细的革兰氏阴性链杆菌(革兰氏染色是常用的一种染色方法，用来鉴别细菌，常分为革兰氏阳性和革兰氏阴性两种细菌，它对诊断和治疗用药都有帮助)，呈短棒状，两端圆，往往成双平行排列，无运动力，无芽孢，是严格的寄生菌。